Shaumi, Karrisa Zahratul (2026) Analisis interaksi molekuler senyawa aktif bakteri endofit akar kelapa sawit sebagai kandidat antifungi terhadap ganoderma boninense secara In silico. Sarjana thesis, UIN Sunan Gunung Djati Bandung.
|
Text (SURAT PENGANTAR DIGILIB)
12. Pengantar Digilib.pdf Download (347kB) | Preview |
|
|
Text (COVER)
01. cover.pdf Download (87kB) | Preview |
|
|
Text (ABSTRAK)
02. Abstrak.pdf Download (214kB) | Preview |
|
|
Text (KETERANGAN BEBAS PLAGIARISME)
03. Keterangan Bebas Plagiarisme .pdf Download (317kB) | Preview |
|
|
Text (DAFTAR ISI)
04. Daftar Isi.pdf Download (194kB) | Preview |
|
|
Text (BAB I)
05. Bab 1.pdf Download (201kB) | Preview |
|
![[img]](https://digilib.uinsgd.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text (BAB II)
06. Bab 2.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB) |
|
|
Text (BAB III)
07. Bab 3.pdf Restricted to Registered users only Download (485kB) |
|
|
Text (BAB IV)
08. Bab 4.pdf Restricted to Registered users only Download (2MB) |
|
|
Text (BAB V)
09. Bab 5.pdf Restricted to Registered users only Download (185kB) |
|
|
Text (DAFTAR PUSTAKA)
10. Daftar Pustaka.pdf Restricted to Registered users only Download (319kB) |
|
|
Text (LAMPIRAN)
11. Lampiran.pdf Restricted to Repository staff only Download (7MB) |
Abstract
Penyakit busuk pangkal batang yang disebabkan oleh Ganoderma boninense merupakan ancaman utama pada budidaya kelapa sawit. Pengendalian penyakit ini masih bergantung pada fungisida kimia sehingga diperlukan alternatif yang lebih ramah lingkungan. Pendekatan in silico melalui molecular docking dapat dimanfaatkan sebagai metode penyaringan awal dalam mengidentifikasi kandidat senyawa antifungi. Penelitian ini bertujuan menganalisis interaksi molekuler senyawa aktif bakteri endofit akar kelapa sawit terhadap protein target Ganoderma boninense, yaitu lakase (Lac), mangan peroksidase (MnP), dan lignin peroksidase (LiP) yang berperan dalam proses infeksi. Senyawa uji diperoleh dari hasil identifikasi GC-MS ekstrak bakteri endofit, sedangkan struktur 3D protein dimodelkan menggunakan homology modeling dan divalidasi sebelum dilakukan molecular docking. Simulasi docking dilakukan menggunakan AutoDock Vina dengan heksakonazol sebagai kontrol positif, kemudian dianalisis berdasarkan energi afinitas (ΔG), konstanta inhibisi (Ki), dan interaksi residu asam amino. Hasil menunjukkan bahwa 3,7-dimethyl-1-phenylsulfonyl-2,6-octadiene dan 1,2-benzenedicarboxylic acid,bis(2-methylpropyl) ester memiliki energi afinitas yang lebih rendah dibandingkan heksakonazol pada ketiga protein target. Nilai energi yang lebih rendah mengindikasikan afinitas pengikatan yang lebih kuat dan kestabilan kompleks ligan-protein lebih tinggi, sehingga kedua senyawa tersebut diprediksi memiliki potensi penghambatan yang lebih baik terhadap Ganoderma boninense. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa kedua senyawa tersebut berpotensi dikembangkan sebagai kandidat antifungi hayati terhadap Ganoderma boninense dan layak dikaji lebih lanjut melalui pengujian in vitro maupun in vivo.
| Item Type: | Thesis (Sarjana) |
|---|---|
| Additional Information: | Penundaan publikasi |
| Uncontrolled Keywords: | Antifungi; bakteri endofit; Ganoderma boninense; in silico; molecular docking |
| Subjects: | Biochemistry > Proteins Microorganisms Microorganisms > Fungi, Eumycophyta Diseases Plant Injuries Plant Injuries > Fungus Diseases |
| Divisions: | Fakultas Sains dan Teknologi > Program Studi Biologi |
| Depositing User: | Karrisa Zahratul Shaumi |
| Date Deposited: | 08 Sep 2026 02:33 |
| Last Modified: | 12 Oct 2026 04:13 |
| URI: | https://digilib.uinsgd.ac.id/id/eprint/140873 |
Actions (login required)
 |
View Item |
