Analisis In silico Protein A35R sebagai Antigen Vaksin Subunit Virus Monkeypox

Putri, Silmi (2025) Analisis In silico Protein A35R sebagai Antigen Vaksin Subunit Virus Monkeypox. Sarjana thesis, UIN Sunan Gunung Djati Bandung.

Preview	Text (COVER) cover.pdf Download (199kB) | Preview
Preview	Text (ABSTRAK) abstrak.pdf Download (264kB) | Preview
	Text (BAB I) bab1.pdf Restricted to Registered users only Download (228kB)
	Text (BAB II) BAB II.pdf Restricted to Registered users only Download (272kB)
	Text (BAB III) bab3.pdf Restricted to Registered users only Download (250kB)
Preview	Text (DAFTAR ISI) daftar isi_removed.pdf Download (231kB) | Preview
	Text (BAB IV) bab4.pdf Restricted to Registered users only Download (227kB)
	Text (BAB V) bab5.pdf Restricted to Registered users only Download (246kB)
Preview	Text (DAFTAR PUSTAKA) dafpus.pdf Download (330kB) | Preview

Abstract

Monkeypox merupakan penyakit zoonotik yang kembali menjadi perhatian global dengan sejumlah besar kasus terkonfirmasi dan kematian yang tercatat secara global sejak awal tahun 2022 hingga pertengahan 2024. Meskipun kasus di Indonesia relatif terkendali, potensi infeksi dan efek samping serius seperti mioperikarditis dan perikarditis tetap menjadi perhatian. Penelitian ini bertujuan menganalisis potensi protein A35R sebagai kandidat antigen vaksin subunit Monkeypox melalui pendekatan in silico. Metodologi yang digunakan mencakup prediksi epitop, uji antigenitas, imunogenitas, toksisitas, alergenitas, pengecekan homologi terhadap protein manusia, molecular docking, validasi dengan evaluasi MM/GBSA, dan analisis ikatan hidrogen. Hasil prediksi menunjukkan terdapat 176 epitop, dengan 28 di antaranya memenuhi kriteria eluted ligand yang mengindikasikan potensi kuat untuk dipresentasikan oleh HLA kelas I. Proporsi 15,91% epitop potensial ini mencerminkan efisiensi prediksi yang lebih baik dibandingkan beberapa studi sebelumnya pada protein lain. Selain itu, ditemukan indikasi cakupan populasi yang lebih luas. Dari 28 peptida yang lolos seleksi awal, 10 epitop memenuhi seluruh kriteria keamanan dan efektivitas, termasuk uji non-toksisitas dan non-alergenitas, dengan 83,3% terdeteksi sebagai non-alergenik. Evaluasi efektivitas menggunakan molecular docking menghasilkan skor energi ikatan yang kuat, berkisar antara -160,047 hingga -266,890, dan energi ΔG_bind berdasarkan MM/GBSA berkisar -51,84 hingga -86,84. Analisis ikatan hidrogen menunjukkan bahwa seluruh kompleks epitop-HLA membentuk interaksi pada Pocket utama F dan B serta Pocket pendukung A, C, D, dan E, yang berperan penting dalam stabilisasi kompleks dan pengenalan antigen oleh sel T. Temuan ini secara signifikan menunjukkan bahwa protein A35R memiliki potensi kuat sebagai kandidat antigen vaksin subunit untuk virus Monkeypox.

Actions (login required)

View Item