Analisis Sidik Jari DNA Beberapa Varietas Unggul Baru Balai Besar Penelitian Tanaman Padi Berdasarkan Marka SSR (Simple Sequence Repeat)

Edi Supriadi, Edi (2016) Analisis Sidik Jari DNA Beberapa Varietas Unggul Baru Balai Besar Penelitian Tanaman Padi Berdasarkan Marka SSR (Simple Sequence Repeat). Diploma thesis, UIN Sunan Gunung Djati Bandung.

Preview	Text (COVER) 1_cover.pdf Download (117kB) | Preview
Preview	Text (ABSTRAK) 2_abstrak.pdf Download (109kB) | Preview
Preview	Text (DAFTAR ISI) 3_daftarisi.pdf Download (225kB) | Preview
Preview	Text (BAB I) 4_bab1.pdf Download (308kB) | Preview
	Text (BAB II) 5_bab2.pdf Restricted to Registered users only Download (727kB)
	Text (BAB III) 6_bab3.pdf Restricted to Registered users only Download (357kB)
	Text (BAB IV) 7_bab4.pdf Restricted to Registered users only Download (827kB)
	Text (BAB V) 8_bab5.pdf Restricted to Registered users only Download (104kB)
	Text (DAFTAR PUSTAKA) 9_daftarpustaka.pdf Restricted to Registered users only Download (328kB)

Abstract

Varietas Unggul Baru (VUB) padi merupakan produk hasil persilangan para pemulia yang memiliki keunggulan masing-masing dari segi sifatnya. Banyaknya VUB yang digunakan oleh para petani mengharuskan para peneliti untuk menganalisis sidik jari DNA dari VUB agar diperoleh informasi mengenai sifat gen dari masing-masing VUB sebagai perlindungan varietas tanaman padi. Analisis sidik jari DNA berdasarkan marka SSR berperan penting dalam masalah ini karena di dalam marka SSR mengandung gen tertentu. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis pola pita DNA dan hubungan kekerabatan VUB. Sebanyak 6 VUB dianalisis dengan menggunakan 12 marka SSR terkait sifat tertentu yang tersebar pada 12 kromosom padi. Separasi dilakukan menggunakan gel poliakrilamid dengan teknik elektroforesis dan dideteksi menggunakan pewarna etidium bromida. Analisis pola pita DNA dan hubungan kekerabatan dilakukan terhadap hasil visualisasi pita DNA dengan menggunakan bantuan perangkat lunak power marker versi 3.25. Hasil analisis pola pita DNA menggunakan gel poliakrilamid menunjukkan terbentuk paling banyak 6 pita DNA pada RM464a dan paling sedikit 1 pita DNA pada RM282. Posisi pita DNA pembeda berdasarkan marka RM315 adalah 175bp, marka RM250 adalah 310bp, RM261 adalah 125bp dan 130bp, marka RM164 adalah 120bp dan 250bp serta 275bp, marka RM510 adalah 110bp dan 120bp, marka RM6344 adalah 315bp dan 600bp, marka RM3571 adalah 175bp, 550bp, 610bp dan 700bp, marka RM464a adalah 115bp, 145bp, 155bp, 240bp, 250bp, 520bp dan 700bp, marka CBG adalah 150bp, 155bp dan 170bp, marka RM3701 adalah 250bp, marka RM5953 adalah 145bp, 150bp dan 155bp. Hasil analisis cluster menunjukkan terbentuknya 3 kelompok yang menunjukkan hubungan kedekatan antar VUB. Kelompok 1 yaitu Ciherang, Inpari 34 dan Inpari 38, kelompok 2 yaitu Inpari 36 dan Inpari 37 dan kelompok 3 yaitu Inpari 35.

Actions (login required)

View Item