Studi in Silico Desain Primer Sitokrom B (CYTB) untuk mendeteksi DNA Babi (Sus Scrofa Domesticus)

Hidayat, Yusuf (2022) Studi in Silico Desain Primer Sitokrom B (CYTB) untuk mendeteksi DNA Babi (Sus Scrofa Domesticus). Sarjana thesis, UIN Sunan Gunung Djati Bandung.

Preview	Text (COVER) 1_cover.pdf Download (443kB) | Preview
Preview	Text (ABSTRAK) 2_abstrak.pdf Download (564kB) | Preview
Preview	Text (DAFTAR ISI) 3_daftarisi.pdf Download (408kB) | Preview
Preview	Text (BAB I) 4_bab1.pdf Download (175kB) | Preview
	Text (BAB II) 5_bab2.pdf Restricted to Registered users only Download (502kB) | Request a copy
	Text (BAB III) 6_bab3.pdf Restricted to Registered users only Download (194kB) | Request a copy
	Text (BAB IV) 7_bab4.pdf Restricted to Registered users only Download (729kB) | Request a copy
	Text (BAB V) 8_bab5.pdf Restricted to Registered users only Download (62kB) | Request a copy
	Text (DAFTAR PUSTAKA) 9_daftarpustaka.pdf Restricted to Registered users only Download (199kB) | Request a copy

Abstract

Banyak produk makanan dengan bahan dasar daging yang ditemukan terkontaminasi dengan daging babi, terutama makanan dengan daging sapi sebagai bahan utamanya. Hal tersebut menjadi permasalahan karena babi merupakan hewan yang haram untuk dikonsumsi bagi umat Islam. Kandungan dan jenis daging dari suatu produk makanan dapat dideteksi menggunakan Polymerase Chain Reaction dengan marker gen sitokrom b. Proses deteksi adanya daging babi pada instrumen PCR membutuhkan primer berupa sekuens DNA rantai pendek sebagai pengenal DNA target secara spesifik. Desain primer dilakukan secara insilico menggunakan situs NCBI, Primer3Plus dan OligoAnalyzer. Tujuan dari penelitian ini adalah mendesain primer spesifik yang dapat digunakan dalam mendeteksi cemaran daging babi pada produk olahan berbahan dasar daging menggunakan metode PCR. Urutan nukleotida gen sitokrom b Sus scrofa domesticus yang digunakan sebagai template diperoleh dari situs www.ncbi.nlm.niv.gov. Hasil rancangan primer gen sitokrom b Sus scrofa domesticus didesain menggunakan software Primer3Plus dan Primer-Blast yang kemudian diidentifikasi untuk memilih satu primer terbaik dari masing-masing software. Primer dengan kriteria primer terbaik dari Primer3Plus adalah primer 5 dengan urutan basa primer ACTTCGGTTCCCTCTTAGGC sebagai primer forward dan AATATGGATGCTCCGTTTGC untuk primer reverse, dan untuk primer terbaik dari Primer-Blast adalah primer 5 dengan urutan basa primer TCCACTTTATCCTGCCATTC sebagai primer forward dan GTCTGATGAGATTCCGGTAG untuk primer reverse.

Actions (login required)

View Item